يتم منع برونو من الذهاب إلى المزرعة بسبب رأي والده رالف في أنهم ليسوا تماما كالبشر. يقرر برونو الذهاب إلى المزرعة سرا ويتعرف على صبي يهودي اسمه شمول من خلال تواجده في الجانب الآخر من السياج الحديدي المكهرب. شمول يخبر برونو بأنه يهودي وأن اليهود تم سجنهم هنا في المعتقل من قبل الجنود وكذلك تم أخذ جميع ملابسهم وإلباسهم ملابس مخططة موحدة وكذلك بأنه جائع. تساور الشكوك برونو في كون والده حقا شخص طيب ولكنه لاحقا بعدما يشاهد فيلما دعائيا مزيفا عن الحياة السعيدة في المعتقل يتأكد من طيبة والده. الصبي في البيجامة المخططة (فيلم) - المعرفة. صار برونو يتردد كثيرا على المعتقل حيث يجلب معه الطعام لصديقه الجديد والوحيد شمول ويلعب معه لعبة الضامة. رجل يهودي كبير في السن اسمه بافيل يعمل خادما في بيت رالف وتتم معاملته بطريقة قاسية من مساعد رالف الضابط كوتلر. بافيل كان سابقا طبيبا وعندما سقط برونو من على الأرجوحة الموجودة في حديقة البيت وأصيبت ركبته عالجه بافيل. قرر رالف تعيين السيد ليزت معلما لغريتيل وبرونو بينما هو يقوم بغسل عقل الطفلين لصالح مبادئ الحزب النازي وضد اليهود. تتجاوب غريتيل مع ما تسمعه لأنها معجبة بمساعد والدها كوتلر بينما يشعر برونو بالضجر بسبب أنه يرى بافيل وشميل ودودين.
وخلال استكشافه قابل صبيًا يجلس على الأرض مرتديًا بيجاما وطوقًا على ذراعه ، دُهش برونو من ضآلة حجم الصبي وحزنه الجليّ ، وفكر أن بإمكانه أن يحظى به كرفيق ، واتضح أن اسم الصبي هو شمويل وكان له نفس يوم الميلاد الخاص ببرونو ، كان شمويل من بولاند وأخبر برونو أنهم في بولاند وليس ألمانيا كما كان يعتقد برونو ، وقبل أن يفترقا خططا للقاء مرة ثانية. ويأتي ارتجاع فني (فلاش باك) آخر عندما قدِم هتلر للعشاء برفقة حبيبته إيفا ، وكان برونو وجريتيل غير مسموح لهما بتناول العشاء مع البالغين ، ثم سمع برونو والداه يتجادلان حول الانتقال وكانت والدته ضد ذلك بالكامل ، ثم يعود المشهد للحاضر ، في اليوم التالى عاد برونو إلى السور وشرح له شمويل ما حدث له ولعائلته قبل أن يأتوا إلى المعسكر. وبعد ذلك بفترة وجيزة دخل برونو مطبخ منزله ليجد شمويل ينظف الأقداح واتضح أن كوتلر قد جلبه للمنزل لينظف الأقداح من أجل حفلة عيد ميلاد الأب ، عرض عليه برونو بعض الدجاج فأكله وبدلًا من أن تكون هذه لفتة جميلة تحولت إلى أمر كارثي فقد أمسك كوتلر بشمويل وانفجر فيه غاضبًا لكنه اعترف أن برونو أعطاه إياها وأنهما صديقان ، لكن برونو قال أن لم يرَه أبدًا من قبل.
طلب من الرجال والطفلين نزع ملابسهم جميعا حيث كانوا يعتقدون بأنهم سيستحمون ولكن تم اقتيادهم إلى غرفة أخرى وهي غرفة الإعدام بالغاز ويتم قتلهم جميعا. في نفس الوقت تكتشف إلسا اختفاء ابنها برونو فتخبر زوجها رالف الذي كان في وسط اجتماع داخلي ويقرر فورا قطع الاجتماع والبحث عن ابنه عن طريق الكلب البوليسي الذي يستطيع اكتشاف الفتحة التي عملها برونو تحت السياج. يدخل رالف إلى المعتقل للبحث عن ابنه ومعه الجنود ولكنه يكتشف أن الغرفة التي يجلس فيها اليهود خالية وبالتالي استنتج بأن ابنه تم اقتياده بطريق الخطأ إلى غرفة الإعدام بالغاز مع باقي اليهود. يصرخ رالف بعلو صوته باسم ابنه برونو وتعلم إلسا بما حدث فتسقط على ركبتيها ومعها ابنتها غريتيل باكية. المشهد الأخير للفيلم يظهر لنا الغرفة التي نزعوا فيها ملابسهم وابقوها فيها ويذكرنا بأن ليست المأساة في وفاة برونو وشمول الطفلين بل في وفاة أيضا اليهود والغجر والمثليين في المحرقة المعروفة. أسا بوتيرفيلد في دور برونو. فيرا فارميغا في دور إلسا. ديفيد ثيوليس في دور رالف. جاك سكانلون في دور شمول. ديفيد هايمان في دور بافيل. روبرت فريند في دور كوتلر. جيم نورتون في دور السيد ليزت.